Hoje em dia, a pronúncia do fonema /ʀ/ como [r] é dialetal, dado que não ocorre na língua-padrão de Portugal, conforme diz esta resposta do Ciberduvidas, citando a gramática de Maria Mateus e outras:
A consoante uvular representada por [R] é a vibrante que se encontra no dialecto-padrão do português europeu [aqui entendida como o dialeto de Lisboa ou Coimbra], em que a sua produção implica a acção da úvula [nota: Pedro Martins indica que a realização mais comum não é vibrante, mas sim [ʁ]]. Em alguns dialectos existe uma variante dental, a vibrante múltipla que se representa por [r].
Essa resposta aponta também genericamente para o norte do país como a região em que [r] é usado, citanto esta outra resposta. Pedro Martins atesta-o em três zonas do norte e numa outra perto de Faro (fig. 4, p. 519).
Se vale a pena o esforço de adaptação agora é contigo; não haverá certamente dificuldade de compreensão (afinal de contas, em Setúbal pronuncia-se /ʀ/ e /ɾ/ da mesma forma e a gente percebe-os), mas é uma pronúncia que em Lisboa será sentida, no mínimo, como marcadamente dialetal.